个人简介
学历、职历、获奖、科研经费与特邀报告
佐藤 玄SATO Hajime
东京大学 农学生命科学研究科 副教授
东京大学 农学生命科学研究科 应用生命工学专业 生物信息工学研究室
以计算化学(量子化学计算、分子动力学计算、机器学习)为核心,致力于阐明萜类等天然产物的生物合成机理,并开展酶的功能改造与设计。
联系方式:hsato[at]bi.a.u-tokyo.ac.jp(请将[at]替换为 @ 后发送) researchmap:researchmap.jp/hajimesato
学历
- 1987 出生于山梨县甲府市
- 2006 山梨县立甲府南高中 理数科 毕业
- 2011 东京理科大学 药学部 毕业
- 2013 东京大学大学院 药学系研究科 硕士课程 修了
- 2016 东京大学大学院 药学系研究科 博士课程 修了(药学博士) 导师:内山真伸 教授
职历
- 2014–2016 理化学研究所 初级研究员(JRA)
- 2016–2021 理化学研究所 客座研究员(兼任)
- 2016–2018 千叶大学大学院 药学研究院 特任研究员 斋藤和季 教授、山崎真巳 副教授
- 2017–2018 加州大学戴维斯分校(UC Davis)博士后研究员 Dean J. Tantillo 教授
- 2018–2020 千叶大学大学院 药学研究院 特任助教
- 2020 日本学术振兴会(JSPS)特别研究员(PD)
- 2020–2024 东京大学 药学部 研究员(兼任)
- 2021–2024 山梨大学 工学部 应用化学科 特任助教(PI)(专职)
- 2021–2024 文部科学省(MEXT)卓越研究员(兼任)
- 2021–2025 科学技术振兴机构(JST)PRESTO《植物分子》研究员(兼任)
- 2025–2026 东京大学 农学生命科学研究科 助教
- 2026–2030 科学技术振兴机构(JST)PRESTO《研发流程革新》研究员(兼任)
- 2026– 东京大学 农学生命科学研究科 应用生命工学专业 生物信息工学研究室 副教授
获奖
- 2023 日本化学信息协会《JAICI 奖》
- 2022 日本药学会《奖励奖》
- 2021 日本药学会 生药天然物部会 2021 年度《奖励研究》
主要科研经费
含资助金额与资助期限的完整列表刊载于研究成果页面。
- 2026 JST さきがけ(2回目)「研究開発プロセス革新」 负责人 《基于自主型人工智能的计算化学全自动化》
- 2026 科研費 挑戦的研究「萌芽」 负责人 《利用机器学习势开发萜类环化反应的高速、全面计算方法》
- 2026 AI For Science (SPReAD) 负责人 《利用自主型 AI 智能体实现萜类环化酶对接模拟的全自动化》
- 2024 科研費「基盤B」 负责人 《运用计算化学解析 variexenol 生物合成的反应调控机制并进行合理改造》
- 2023 稲盛財団「研究助成」 负责人 《实验科学与计算化学协同解析萜类环化酶》
- 2023 公益財団法人 アステラス病態代謝研究会「研究助成」 负责人 《计算化学与实验科学协同设计萜类环化酶》
- 2022 科研費「若手研究」 负责人 《基于计算化学、有机合成化学与生物化学的萜类环化反应解析》
- 2022 科研費「学術変革領域研究A」「予知生合成科学」計画班 参与者 《运用计算科学阐明未知生物合成途径并创制未知天然产物》
- 2022 令和4年度山梨県大村智人材育成基金 山梨県若手研究者奨励事業 负责人
- 2021 JST さきがけ(1回目)「植物分子」 负责人 《运用计算化学解析萜类环化酶与氧化酶的反应机理并改造其功能》
- 2021 上原記念生命科学財団 研究奨励金 负责人 《基于计算化学的萜类环化酶功能解析》
- 2021 テルモ生命科学振興財団 助成金 负责人 《理论与实验协同研究天然产物的结构多样性》
- 2020 MEXT 卓越研究員(代表) 负责人 《理论与实验协同开拓未知天然产物化学》
- 2020 日本学術振興会 特別研究員(PD) 研究奨励金 负责人 《基于计算化学、基因工程与分子生物学的植物次级代谢酶解析与设计》
特邀报告
-
2025年12月15–20日
Pacifichem 2025(美国 夏威夷)
Biosynthesis of Natural Products and Biomaterials (BIO009)
《Mechanistic Investigation of Terpene Cyclases using Computational Chemistry and Artificial Intelligence》 - 2025年8月29日 1st Japanese–Australasian Symposium on the Biosynthesis of Natural Products(澳大利亚 悉尼) 《AI-Assisted Computational Study of Terpene Cyclization Mechanism》
- 2025年8月4–8日 TERPNET 2025(澳大利亚 布里斯班) 《AI-Assisted Prediction of Terpene Cyclization Mechanism》
- 2025年6月4日 2025 年度 学术变革领域研究 A 数字有机合成青年研讨会(岩手大学) 《运用计算化学解析萜类环化酶》
- 2024年12月9日 2024 年度 日本化学会关东支部讲演会(山梨大学) 《揭开分子的幕后 — 计算化学带来的新发现》
- 2024年11月25日 先驱项目 2024 研讨会 新型化学模态连接的光生命科学基地(金泽大学) 《计算化学挑战萜类生物合成研究》
- 2024年6月13日 横滨国立大学 特邀报告 《以计算化学为核心的分子设计与反应解析》
- 2023年12月20日 日本药学会关东支部线上研讨会 《以理论计算为核心的天然产物生物合成机理研究》
- 2023年10月19日 东京理科大学 药学部(野田校区) 《以理论计算为核心的天然产物生物合成研究》
- 2023年10月13日 山梨县立甲府南高中 SSH 相关项目 《药学研究:从基础到前沿》
- 2021年11月29日 GTR Chemistry Workshop 2021(名古屋大学 卓越研究生院项目) 《以理论计算为核心的天然产物生物合成研究》
- 2020年1月29日 理化学研究所 CSRS 信息学与数据科学推进项目 成果报告会 《基于计算化学阐明萜类生物合成中结构多样性的产生机制》
- 2018年10月9日 植物科学青年研究者会(千叶大学 植物分子科学研究中心) 《从计算化学与实验科学两方面研究赖氨酸来源生物碱的生物合成》
- 2017年11月2日 东京大学 农学部 《Theoretical Studies on Terpene-Forming Carbocation Cyclization/Rearrangement Reactions》
代表性论文
1Enzymatic skeletal editing reaction forming the 1,3,5-triazine core during biosynthesis of the anticancer nucleoside analog 5-azacytidine
Nature Catalysis, 2026, accepted.
2Formal Chemoenzymatic Skeletal Editing of Fusicoccane Core to Access 6-Aza-fusicoccanes
JACS Au 2026, in press.
3<a id="2024JACS_Au">DFT Study on Retigerane-type Sesterterpenoid Biosynthesis: Initial Conformation of GFPP Regulates Biosynthetic Pathway, Ring-construction Order and Stereochemistry</a>
JACS Au, 2024, 4, 3484–3491.
4Revision of Peniroquesine Biosynthetic Pathway by Retro-biosynthetic Theoretical Analysis: Ring Strain Controls the Unique Carbocation Rearrangement Cascade
JACS Au, 2023, 3, 1596-1603.
5Elucidation of Late-stage Biosynthesis of Phomoidride: Proposal of Cyclization Mechanism Affording Characteristic 9-Membered Ring of Fungal Dimeric Anhydride
J. Am. Chem. Soc., 2022, 144, 20998-21004. (#: equall contribution)
6Molecular and Computational Bases for Spirofuranone Formation in Setosusin Biosynthesis
J. Am. Chem. Soc., 2021, 143, 17708–17715.
7DFT Study on the Biosynthesis of Verrucosane Diterpenoids and Mangicol Sesterterpenoids: Involvement of Secondary-carbocation-free Reaction Cascades
JACS Au, 2021, 1, 1231–1239.
8DFT Study of a Missing Piece in Brasilane-Type Structure Biosynthesis: An Unusual Skeletal Rearrangement
J. Am. Chem. Soc., 2020, 142, 19830–19834.
9Biosynthesis of Indole Diterpene Lolitrems: Radical‐Induced Cyclization of an Epoxyalcohol Affording a Characteristic Lolitremane Skeleton
Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 17996–18002.
10Functional Analysis of a Biosynthetic Gene Cluster Demonstrates Role of Spontaneous Double Bicyclo-ring Formation Including 8π–6π Electrocyclization in Shimalactone Biosynthesis
Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 8464–8470.
11Computational Studies on Biosynthetic Carbocation Rearrangements leading to Quiannulatene: Initial Conformation Regulates Biosynthetic Route, Stereochemistry, and Type of Skeleton.
Angew. Chem. Int. Ed., 2018, 57, 14752–14757.
12Structural and Computational Basis for Dramatic Skeletal Rearrangement in Anditomin Biosynthesis.
J. Am. Chem. Soc., 2018, 140, 9743–9750.