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个人简介

学历、职历、获奖、科研经费与特邀报告

佐藤玄的照片

佐藤 玄SATO Hajime

东京大学 农学生命科学研究科 副教授

东京大学 农学生命科学研究科 应用生命工学专业 生物信息工学研究室

以计算化学(量子化学计算、分子动力学计算、机器学习)为核心,致力于阐明萜类等天然产物的生物合成机理,并开展酶的功能改造与设计。

联系方式:hsato[at]bi.a.u-tokyo.ac.jp(请将[at]替换为 @ 后发送) researchmap:researchmap.jp/hajimesato

Education

学历

  • 1987 出生于山梨县甲府市
  • 2006 山梨县立甲府南高中 理数科 毕业
  • 2011 东京理科大学 药学部 毕业
  • 2013 东京大学大学院 药学系研究科 硕士课程 修了
  • 2016 东京大学大学院 药学系研究科 博士课程 修了(药学博士) 导师:内山真伸 教授
Appointments

职历

Awards

获奖

  • 2023 日本化学信息协会《JAICI 奖》
  • 2022 日本药学会《奖励奖》
  • 2021 日本药学会 生药天然物部会 2021 年度《奖励研究》
Grants

主要科研经费

含资助金额与资助期限的完整列表刊载于研究成果页面。

Invited lectures

特邀报告

  • 2025年12月15–20日 Pacifichem 2025(美国 夏威夷) Biosynthesis of Natural Products and Biomaterials (BIO009)
    《Mechanistic Investigation of Terpene Cyclases using Computational Chemistry and Artificial Intelligence》
  • 2025年8月29日 1st Japanese–Australasian Symposium on the Biosynthesis of Natural Products(澳大利亚 悉尼) 《AI-Assisted Computational Study of Terpene Cyclization Mechanism》
  • 2025年8月4–8日 TERPNET 2025(澳大利亚 布里斯班) 《AI-Assisted Prediction of Terpene Cyclization Mechanism》
  • 2025年6月4日 2025 年度 学术变革领域研究 A 数字有机合成青年研讨会(岩手大学) 《运用计算化学解析萜类环化酶》
  • 2024年12月9日 2024 年度 日本化学会关东支部讲演会(山梨大学) 《揭开分子的幕后 — 计算化学带来的新发现》
  • 2024年11月25日 先驱项目 2024 研讨会 新型化学模态连接的光生命科学基地(金泽大学) 《计算化学挑战萜类生物合成研究》
  • 2024年6月13日 横滨国立大学 特邀报告 《以计算化学为核心的分子设计与反应解析》
  • 2023年12月20日 日本药学会关东支部线上研讨会 《以理论计算为核心的天然产物生物合成机理研究》
  • 2023年10月19日 东京理科大学 药学部(野田校区) 《以理论计算为核心的天然产物生物合成研究》
  • 2023年10月13日 山梨县立甲府南高中 SSH 相关项目 《药学研究:从基础到前沿》
  • 2021年11月29日 GTR Chemistry Workshop 2021(名古屋大学 卓越研究生院项目) 《以理论计算为核心的天然产物生物合成研究》
  • 2020年1月29日 理化学研究所 CSRS 信息学与数据科学推进项目 成果报告会 《基于计算化学阐明萜类生物合成中结构多样性的产生机制》
  • 2018年10月9日 植物科学青年研究者会(千叶大学 植物分子科学研究中心) 《从计算化学与实验科学两方面研究赖氨酸来源生物碱的生物合成》
  • 2017年11月2日 东京大学 农学部 《Theoretical Studies on Terpene-Forming Carbocation Cyclization/Rearrangement Reactions》
Selected papers

代表性论文

1Enzymatic skeletal editing reaction forming the 1,3,5-triazine core during biosynthesis of the anticancer nucleoside analog 5-azacytidine

A. Umezawa†, T. Tsunoda†, Y. Nakashima†, Y.-L. Wang, T. Yoneda, C. Maruyama, N.-S. Hsu, T. Matsuyama, K. Miyamoto, H. Sato, A. Shimose, R. Takazawa, Y. Hamano, T.-L. Li, Y. Inokuma, M. Uchiyama, Y. Ogasawara*, H. Morita*, T. Dairi*

Nature Catalysis, 2026, accepted.

DOI: 10.1038/s41929-026-01611-x

2Formal Chemoenzymatic Skeletal Editing of Fusicoccane Core to Access 6-Aza-fusicoccanes

Seiya Endo, Eigo Fukuda, Ken-ya Hori, Kei-ichi Murai, Atsushi Nakayama, Yoko Yasuno, Masayoshi Arai, Hajime Sato, Tomohisa Kuzuyama, Tetsuro Shinada

JACS Au 2026, in press.

DOI: 10.1021/jacsau.6c00833

3<a id="2024JACS_Au">DFT Study on Retigerane-type Sesterterpenoid Biosynthesis: Initial Conformation of GFPP Regulates Biosynthetic Pathway, Ring-construction Order and Stereochemistry</a>

Yuichiro Watanabe, Takahiro Hashishin, Hajime Sato,* Taro Matsuyama, Masaya Nakajima, Jun-ichi Haruta, Masanobu Uchiyama*

JACS Au, 2024, 4, 3484–3491.

DOI: 10.1021/jacsau.4c00313

4Revision of Peniroquesine Biosynthetic Pathway by Retro-biosynthetic Theoretical Analysis: Ring Strain Controls the Unique Carbocation Rearrangement Cascade

Taro Matsuyama,† Ko Togashi,† Moe Nakano, Hajime Sato,* Masanobu Uchiyama*

JACS Au, 2023, 3, 1596-1603.

DOI: 10.1021/jacsau.3c00039

5Elucidation of Late-stage Biosynthesis of Phomoidride: Proposal of Cyclization Mechanism Affording Characteristic 9-Membered Ring of Fungal Dimeric Anhydride

Shintaro Yamamoto,# Taro Matsuyama,# Taro Ozaki,* Jyunya Takino, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama,* Atsushi Minami,* and Hideaki Oikawa

J. Am. Chem. Soc., 2022, 144, 20998-21004. (#: equall contribution)

DOI: 10.1021/jacs.2c09308

6Molecular and Computational Bases for Spirofuranone Formation in Setosusin Biosynthesis

Xingxing Wei, Taro Matsuyama, Hajime Sato,* Dexiu Yan, Pui Man Chan, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama,* and Yudai Matsuda*

J. Am. Chem. Soc., 2021, 143, 17708–17715.

DOI: 10.1021/jacs.1c08336

7DFT Study on the Biosynthesis of Verrucosane Diterpenoids and Mangicol Sesterterpenoids: Involvement of Secondary-carbocation-free Reaction Cascades

Hajime Sato,* Bi-Xiao Li, Taisei Takagi, Chao Wang, Kazunori Miyamoto, and Masanobu Uchiyama*

JACS Au, 2021, 1, 1231–1239.

DOI: 10.1021/jacsau.1c00178

8DFT Study of a Missing Piece in Brasilane-Type Structure Biosynthesis: An Unusual Skeletal Rearrangement

Hajime Sato,* Takahiro Hashishin, Junichiro Kanazawa, Kazunori Miyamoto and Masanobu Uchiyama*

J. Am. Chem. Soc., 2020, 142, 19830–19834.

DOI: 10.1021/jacs.0c09616

9Biosynthesis of Indole Diterpene Lolitrems: Radical‐Induced Cyclization of an Epoxyalcohol Affording a Characteristic Lolitremane Skeleton

Yulu Jiang, Taro Ozaki, Mei Harada, Tadachika Miyasaka, Hajime Sato, Kazunori Miyamoto, Junichiro Kanazawa, Chengwei Liu, Jun-ichi Maruyama, Masaatsu Adachi, Atsuo Nakazaki, Toshio Nishikawa, Masanobu Uchiyama, Atsushi Minami,* Hideaki Oikawa*

Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 17996–18002.

DOI: 10.1002/anie.202007280

10Functional Analysis of a Biosynthetic Gene Cluster Demonstrates Role of Spontaneous Double Bicyclo-ring Formation Including 8π–6π Electrocyclization in Shimalactone Biosynthesis

Isao Fujii,* M. H., K. K., A. U., H. S., K. S., H. T., M. I., S. Y., A. K., R. F., A. H., K. S., T. A., J. I., D. W., Y. G., A. Watanabe, M. Watanabe, Y. Masumoto, J. Kanazawa, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama*

Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 8464–8470.

DOI: 10.1002/anie.202001024

11Computational Studies on Biosynthetic Carbocation Rearrangements leading to Quiannulatene: Initial Conformation Regulates Biosynthetic Route, Stereochemistry, and Type of Skeleton.

Hajime Sato,* Takaaki Mitsuhashi, Mami Yamazaki, Ikuro Abe,* Masanobu Uchiyama*

Angew. Chem. Int. Ed., 2018, 57, 14752–14757.

DOI: 10.1002/anie.201807139

12Structural and Computational Basis for Dramatic Skeletal Rearrangement in Anditomin Biosynthesis.

Yu Nakashima, Takaaki Mitsuhashi, Yudai Mtsuda, Miki Senda, Hajime Sato, Mami Yamazaki, Masanobu Uchiyama,* Toshiya Senda,* Ikuro Abe*

J. Am. Chem. Soc., 2018, 140, 9743–9750.

DOI: 10.1021/jacs.8b06084